睑板腺囊肿的患者可以挂眼科、眼表科、眼外科等接受治疗。
如果患者的病症表现较轻、囊肿较小、脓肿尚未形成，此时不需要手术等方式进行干预，患者则可以直接挂综合性眼科，通过药物治疗或者其他物理方式缓解病情。如果到专业性强的眼科医院就诊，也可以挂眼表科、眼睑病科进行就医。
如果保守治疗后，囊肿仍然有扩大的趋势或者已完全形成脓肿，患者可以考虑通过手术的方式干预，此时可以挂眼表外科、眼部门诊外科或者眼睑病科进行切开手术治疗。