男性不育的检查项目分为一般检查和专科检查，若是由于遗传因素导致的，还需要进行染色体的检查。
一般检查项目分为身高、体重、血压、血常规、血生化、凝血功能、血型等。专科检查项目分为男性外生殖器检查、精液常规检查和畸形率的分析、男性激素检查等。
精液分析结果需要与临床检查相对应，如果精液分析结果正常，就无需进行第二次分析。如果分析结果与第一次相差很大，则需进行第三次精液分析。进行生殖内分泌激素检查时，建议空腹进行。