肛瘘的手术方法主要就是通过切除的方法进行治疗。
如果是低位的单纯性的肛瘘，可以直接切除原发的感染内口，切除肛瘘的管道部分，以及肛瘘的外口。如果是高位的复杂性的肛瘘，一般会采用挂线的手术方法，主要的目的就是最大程度上保护肛门括约肌的功能。另外还可以起到引流的作用，减少术后的肛门组织的损伤，减少术后复发的几率。
肛瘘是属于肛门周围感染化脓性的疾病，一般都是由于肛门周围的脓肿发生了溃破发展而来，主要的检查方法是通过肛门局部的检查，可以通过肛门局部的望诊、肛门的触诊进行初步的诊断。必要时可以进行肛门周围核磁共振的检查，或者是直肠内超声的检查。
诊断明确以后，主要的治疗方法是通过手术进行治疗。