输尿管息肉与结石、感染、内分泌失调等因素有关。
输尿管息肉是一种良性病变，其发病原因目前不十分清楚。在临床上最常见的是输尿管结石引起的息肉，其主要原因是结石嵌顿于输尿管内，不能向下排出，结石下方的输尿管出现息肉、增生等情况。
除此之外，慢性炎症的刺激、内分泌失调等原因，也可导致输尿管息肉的形成。大部分输尿管息肉都是后天形成的，先天性因素导致输尿管息肉很少见。据统计，输尿管上段1/3处和输尿管肾盂连接处，是最常见的好发部位。