流感的并发症包括肺内并发症和肺外并发症。肺内并发症主要指病毒性肺炎或继发性细菌性肺炎，或细菌与病毒混合性肺炎。肺外并发症包括：
1.瑞氏综合征。多见于甲型乙型流感导致的肝脏神经系统并发症，患者发病后出现恶心、呕吐，继而出现嗜睡、昏迷等症状。
2.中毒性休克综合征。多在流感出现后，伴有呼吸衰竭，胸片可以发现急性呼吸窘迫综合征。
3.横纹肌溶解。是局部或全身骨骼肌坏死的表现，患者出现肌痛，可以出现急性肾衰竭。
4.其他中枢神经系统并发症。如脑炎、急性坏死性脑病等。