头顶摸起来疼的原因如下：
1.枕神经头痛。例如枕神经痛的时候头顶摸起来疼，本病发病的时候会出现后脑勺及头顶剧烈疼痛。
2.头顶局部外伤。当头皮外伤以后会表现为局部肿胀，按压头皮会有明显疼痛的症状，头顶皮肤摸起来疼。如果有颅骨骨折，按压时疼痛更为明显。
3.毛囊炎。当头顶部皮肤出现局部感染的时候，有明显红、肿、热、痛的症状，头顶摸起来疼。
4.疱疹病毒感染的时候，有局部疼痛的症状，并伴有疱疹形成，头顶摸起来会有疼痛感，可局部应用抗病毒治疗。