宝宝先咳嗽，后发烧的原因，通常是因为感染呼吸系统疾病引起的，比如气管炎、肺炎等。
由于小儿气道管腔狭窄，因此，感染病原菌后会刺激气道黏膜，出现咳嗽的症状。加之孩子体温调节中枢发育还不完善，会在致病菌产生的致热原的作用下出现持续发烧的现象。另外，宝宝先咳嗽，后发烧，也可能是其他异物导致的。由于气道误吸异物，因此出现刺激性的呛咳。如果没能及时发现，并将异物去除，又因为异物长时间对气道的不利影响而导致炎症性的改变，出现发热的现象。
需要及时进行小儿体格检查、实验室化验和影像学检查，明确病因后，再给予针对性的治疗。