乙肝核心抗体阳性表示曾经感染过HBV，这是一个永远的标志，即只要曾经感染过乙肝病毒就会存在，但在实际检测中，由于不同时段核心抗体在体内的水平不同或者在不同医院检查，仪器和试剂之间的误差，有时呈“阴性”。但从医学理论上讲，核心抗体是一个标志性抗体，乙肝核心抗体阳性，要和表面抗原、E抗原在一起分析才有临床意义，单独核心抗体阳性，只能说感染过HBV。但没特别的临床症状，临床上大三阳小三阳都不一定有症状，主要看肝功能，肝功能有问题才可能会出现临床症状，如黄疸、消化不良等。
乙肝核心抗体阳性有两种意义。一种是乙肝核心抗体阳性，但IgM抗体水平较低，表示以前感染过乙肝病毒，现在已经康复，可以和正常人一样的生活。另外一种是乙肝核心抗体阳性IgM抗体的水平也比较高，表明体内有乙肝病毒存在，且乙肝病毒正在复制，有传染性，这种情况需要进行抗病毒治疗。