男性生殖器畸形手术之后，除了一般注意事项外，还需要定期复查。同其它手术一样，男性生殖畸形手术之后要禁食辛辣食物一个月，避免烟、酒的刺激，避免一些发物，如羊肉等。
手术之后还要观察切口有无感染、切口愈合情况、有无皮瓣坏死、有无血肿的形成等。
除此之外，手术之后还需要定期复查，比如隐睾的患者行睾丸下降固定术，术后需要观察睾丸是否发生萎缩、坏死、是否发生恶变等情况，如果发生上述情况，则需要及时将病变睾丸切除，以免引起严重的并发症。