胃肠道功能紊乱的产生，一方面可能和器质性胃肠道疾病有关系。比如长时间消化性溃疡、慢性肠炎、溃疡性结肠炎等，会引起自身胃肠道功能的紊乱。
另一方面，长时间饮食不合理、缺乏运动、长时间吃抗生素药品，引起肠道菌群紊乱等因素，都可能会引起自身胃肠道功能发生紊乱。
所以，具体应该结合自己出现胃肠道功能紊乱的疾病，进行相关的药物治疗。平时注意适当运动，辅助肠道功能的恢复。同时要注意观察是否存在一定的焦虑心理因素，因为有些胃肠功能紊乱是在焦虑背景情况下引起。