小儿窦性心动过缓的治疗，首先选择抗心律失常药物治疗。当药物治疗无效或不能改善症状时，需要安装起搏器来治疗，这样能有效防止小儿心脏功能受损。
抗心律失常药物，有异丙肾上腺素，主要用于急性期治疗，需要严格控制输液速度，不要将心率很快就提高到正常范围，以免加重心肌的损害。
还有阿托品，常用于症状较轻的小儿，口服可维持心率处于正常的范围，就不需要输液维持，还有山莨菪碱也用于症状较轻的小儿，具体药量还要在专业医生指导下应用。