上呼吸道感染有20%~30%的概率是因为细菌感染所引起，可以选用的抗生素主要有苯唑西林、青霉素钠、阿莫西林克拉维酸钾、美洛西林等。
还可以选用一些头孢类的抗生素，比如头孢唑林、头孢哌酮舒巴坦钠、头孢拉定、头孢克洛等。喹诺酮类药物也是可以，比如环丙沙星、左氧氟沙星等。
除了以上的抗生素以外，还有大环内酯类抗生素，比如阿奇霉素、罗红霉素或者克林霉素。病人在使用抗生素之前需要做药敏检测，不能滥用抗生素。如果是病毒感染所导致的，一般不需要使用抗生素。