具有明显的严重生殖道感染，或者处于全身一些疾病的感染急性期，严重的心脏病或者血液病患者，属于人工流产禁忌症。
严重的感染，在做人流手术后有可能会引起局部逆行感染，发生盆腔炎性疾病，造成一系列的盆腔炎后遗症表现。而严重的心脏病需要在心内科医生会诊之后，综合评估孕妇继续妊娠的风险，和做人流的风险哪一个更高，再给出适当的治疗方案。
绝症患者做人流手术，有可能会造成术中和术后的大出血，严重威胁孕妇生命，也是需要学科会诊之后，综合评估病情再制定方案。