生殖器畸形异常，确切的治疗手段是安排手术矫形处理，术后达到改善外观畸形状态，最大限度恢复性功能以及排尿功能。
矫形手术的方案制定还需要结合畸形的具体部位，以及畸形严重程度决定。常见的龟头型尿道下裂导致的畸形外观，可以不需要考虑手术矫形处理，由于这种畸形异常不影响排尿，也不影响勃起和射精，对日常生活也不会造成影响。
不要自行盲目服药治疗，由于已经存在畸形异常的情况下，单一的药物保守方式治疗达不到确切效果。