一般情况下，黄疸过高对宝宝的眼睛没有伤害。
但是，如果是病理性的黄疸的宝宝，在照蓝光时因为治疗箱内灯管的热度可以使周围的温度升高，可能会刺激小儿的眼睛，所以在进行蓝光照射时要给孩子戴好眼罩。除此之外，也要注意生殖部位的遮盖，遮盖物要采用不透光的材料。综上所述，只要防护到位，对于宝宝眼睛是不会造成伤害的。
经过照射后分解后的产物也会经过肠道排出体外，所以也可能会刺激肠壁引起肠道蠕动的异常，家长要引起重视。