脑血栓伴随心脏功能障碍的患者，首先就是增加心脏的功能，如使用洋地黄类的药物，可以增加心脏的收缩，以起到增加心脏泵血功能的效果。
并且使用利尿剂，也可以减轻心脏的负担，而使心脏的功能得到保护。还可以使用一些中成类药，对于缓解脑血栓伴随心脏功能障碍的，还是有着非常好的效果的。因为这些中成药有活血化瘀减轻症状，增加心脏的泵血功能的效果，
并且针对脑血栓也应该进行相应的治疗，当然在使用药物上要注意对于心脏的保护，以及在使用药物的时候，尽量的起到心脑血管同时治疗的效果。
上述药物应用均需在专业医生指导下应用，需要正规治疗。