晨尿很臭多考虑可能是由于整晚没有排尿，导致尿液在膀胱内长时间储存，致使尿液过度浓缩，容易分解产生少量的氨气，就会导致晨尿有臭味。这种情况属于正常的生理现象，通过晨起后适量多喝水，有利于快速减轻尿臭现象。
如果尿臭现象一直存在，多考虑可能泌尿系统化脓性感染所引起。常见于化脓性肾盂肾炎，可导致病人的尿液当中出现腥臭味。通过尿液常规检查，可发现尿液当中存在大量的白细胞，需要积极进行抗感染治疗，有利于尿臭味逐渐消失。
此外，还可能为结肠瘘所引起。由于尿液当中存在粪便残留，就会导致尿液有臭味。