眼眶真菌病在临床上发病率非常低。常见的致病菌有曲霉菌、毛霉菌和隐球菌，当然还有放线菌和青霉菌。
这些真菌其实是正常的存在于人体正常组织内的活体的组织里的，比如说鼻窦、结膜囊，一般不治病，但是当患者的机体免疫力下降或者说是大量的使用皮质激素这样的时候，寄身的这种真菌可以条件性地治病。
可以用x线片来检查眼眶周围可以显示鼻窦的密度增高，眶骨有破坏，眶内软组织的密度影不容易被发现；也可以用超声检查，b型超声可以看到框内形状不规则的占位性的病变；ct扫描可以显示框内的形状以及它的性质可以进行进一步的辨别；最重要的是病变组织的活检，如果发现真菌菌丝，那么就可以确诊。