奥硝唑和甲硝唑本身是属于同一类药物的，一般对于滴虫或者厌氧菌，或者部分杆菌的治疗方面，并不会有太大的差别。相对奥硝唑这个要更新一些，作用有的会偏强一些。但是，甲硝唑在产科方面才是属于b类药，相对胚胎毒性会更弱一些。
所以如果是在妊娠期需要用药，一般都只能是选择甲硝唑。比如妊娠期检查到有滴虫性阴道炎，或者是明确的厌氧菌感染，或者牙科疾病等情况，必须用药的时候可以只选择甲硝唑。
哺乳期也是一样，必须用药时只可以选择甲硝唑。