肾结石有后遗症。未有效将结石排出的情况下，可伴随泌尿道感染、结石嵌顿，肾、输尿管积水。严重的肾积水未得到及时纠正，还可影响肾脏功能。
一旦是检查提示患有肾结石，需要根据超声定位，并且测量结石的经线值。细小的肾结石可药物排石处理，同时增加饮水以及蹦跳活动，可以促使细小的结石随尿液一并排出。
通过保守方式不能将结石有效排出，可选择体外震波碎石方式处理，或者是经皮肾手术将结石取出。只有将结石有效排出后，可降低感染、嵌顿以及泌尿道积水现象的发生。