幽门螺杆菌检查需要空腹，而且至少需要空腹两小时以上。在进行检查之前不能进食任何的食物，包括水都不能进食，否则有可能会影响检查的结果。
因为进食以后尿素成分不能均匀地分布在胃黏膜，检查幽门螺旋杆菌前，一个月之内都要避免服用消炎药物。如果一个月之内有口服抗炎药物，应该要推迟该检查项目。
临床当中检查幽门螺杆菌，比较常用的方法就是碳13或者碳14的尿素呼气试验。如果出现检查结果阳性，要考虑有受到幽门螺旋杆菌的感染。