儿童怪病也有可能会伤及儿童的呼吸系统。因为儿童怪病它的基本的病理基础是全身性的血管炎。
全身性的血管炎只要由血管的地方，它都可能发生血管的炎症。所以当肺部的血管出现的血管炎的情况，它也就会影响到呼吸系统，造成呼吸系统功能的障碍出现症状。而且往往是全身性的血管炎，是由于过度的免疫反应以及免疫损伤所造成的，孩子的肺部可能还会出现一些单核细胞和巨噬细胞的浸润的情况，所以会影响到孩子的呼吸系统。
因为这个疾病目前病因不是十分清楚，而且它的疾病的转归也不太清楚。主要认为它是一个类川崎病。所以目前的治疗主要是根据川崎病的治疗来进行。