初期的肛裂治疗起来还是比较简单，具体的治疗方法可遵照以下步骤。首先，最好使用具有消肿止痛效果的中药泡水熏洗肛门周围，常用的药物有荆芥、艾叶、防风等，在药物的作用下肛门括约肌彻底松弛，裂口周围的血运得到明显改善，有利于下一步的治疗。
其次，坐浴后裂口可以暴露出来，这时再使用红霉素软膏等消炎的药膏涂抹，可起到治疗慢性溃疡的作用，有条件的还可以将一些治疗痔疮的栓剂放入肛内，这些栓剂虽然是治疗痔疮，但有改善肛管血运的效果，同样可以用于治疗肛裂。
最后，如果肛裂是由便秘导致，在治疗时一定要配合使用通便的药物，这样可以软化粪便，避免将愈合的裂口再次撑开。