流感后出现咽喉疼痛难忍，多是由于上呼吸道被流感病毒入侵后，引起呼吸道感染，这时可出现疼痛的症状。还有一些会伴随扁桃体肿大，这时也会引起疼痛难忍的表现。
另外，流感后咽喉疼痛难忍，也有可能与局部刺激有关。患者可能会伴随频繁咳嗽的症状，对咽喉会产生比较大的刺激作用，因此可出现疼痛。如果咽部本身存在炎症，这时也会出现咽喉疼痛。
最好到医院进一步检查有无出现慢性扁桃体炎、咽喉炎等病情。若与流感有关，可以服用奥司他韦等抗病毒药物来改善症状。合并细菌感染时，可以应用抗生素进行治疗，比如头孢类药物。