高低肩畸形通常并不是由于颈椎变形而导致的，在日常生活中，高低肩通常是由于以下几种原因导致的：
首先，导致高低肩畸形，最为常见的原因就是脊柱畸形，这里指的脊柱畸形并不是颈椎畸形，而是胸椎以及腰椎，尤其是胸椎畸形，会直接导致高低肩畸形、双侧肩关节不平等。
其次，导致高低肩畸形，还有可能是日常姿势不正，双侧肩关节肌肉力量不均衡，由于双侧力量不同，所以就会导致一侧高一侧低。
另外，导致高低肩畸形还有可能是先天性斜颈引发的，是由于某一侧的胸锁乳突肌收缩而使肩关节明显抬高。