患者感染了异尖线虫病早期的症状主要有剧烈的腹痛、恶心、呕吐、腹泻等一系列的消化道表现，症状比较明显，病情的轻重程度与感染的持续时间以及寄生部位有很大的关系。
异尖线虫的幼虫，能够寄生于患者的胃黏膜、肠黏膜、以及咽喉处，其中受损最严重的是胃部，要超过肠道的两倍。异尖线虫病主要是由于异尖线虫的第3期幼虫在人体的胃肠道内寄生所导致的一种疾病，因为患者使用了含有活体幼虫的海鱼所引发。
患者的实验室检查会出现嗜酸性粒细胞增高，本病的潜伏期一般是2~20个小时，其中发病最短的可由生食了鱼片之后半个小时就发病，慢性期的患者有可能会并发腹膜炎、肠梗阻以及肠穿孔。