发烧39.5℃是否由新型冠状病毒感染引起要具体分析。
体温39.5℃时属于高热，引起高热的原因有很多，首先考虑感染性的发热，例如由细菌或病毒感染呼吸系统、泌尿系统、胆道系统时，均可以出现高热的症状。此外，非感染性疾病也可以引起高热，例如淋巴瘤、白血病等。
在新型冠状病毒疫情期间，对于新型冠状病毒肺炎的患者可以出现高热的症状，而且高热也是其常见和主要的临床表现。此时如果患者有流行病学史，胸部CT有病毒性肺炎形成，且新型冠状病毒核酸检测和抗体检测为阳性，则考虑为新型冠状病毒肺炎。
故当出现高热时，要针对性完善相应检查，进行病因的鉴别。在疫情期间，不能仅凭有高热就判断有新型冠状病毒感染。