吃药治疗甲亢没效果，动手术大多可以根治。手术治疗甲亢适用于中、重度甲亢、长期服药无效、停药后复发或不愿长期服药的患者。
手术治疗的治愈率在70%以上，但可能会引起多种并发症。主要常见的并发症为甲状腺功能减退，约1/3患者术后可出现甲减，有的持续2～3个月能自行恢复。如果持续时间超过6个月仍不能恢复，则多为永久性甲减，需要甲状腺素片终身替代治疗。
为了减少甲亢复发及尽量祛除病变组织，且甲减的治疗较治疗甲亢复发容易得多，所以术后甲减并不能视为甲状腺手术失败。