对于轻度的高原反应的患者，通常经过积极的治疗，预后较好，绝大多数的轻症都能够自愈。所以出现症状的时候，一定要早期诊断进行治疗，防止疾病的进一步进展。
但是如果患者治疗不及时，或者对于既往有明显的原发基础性疾病的人群、老年人、免疫力低下的人群，有可能会留有相应的后遗症。严重时患者会出现继发性的高原肺水肿、高原脑水肿，甚至会出现威胁生命的多脏器功能不全的并发症。例如患者出现恶性心律失常、严重的颅脑功能受损，这些后遗症都属于相对比较严重的情况。
一旦患者出现上述症状，必须尽快地转移到平原进行抢救和治疗。