一般大的肾囊肿可能会导致患者出现腰酸、腹胀，这时候就需要治疗。肾囊肿治疗的方法虽然是因人而异的，但是肾囊肿治疗以后的效果，总体是比较令人满意的。
一般对于4~5厘米的单纯性肾囊肿，可以使用超声引导下进行肾脏囊肿穿刺术。这种治疗方法简单、安全、副作用小、恢复快、近期效果好，但是少数患者远期有复发的可能。
对于5厘米以上的比较大的肾囊肿，也可以选择外科手术治疗。外科手术治疗一般很少复发，囊肿不再长大，疗效比较确切。当然，肾囊肿除了介入微创治疗或者外科手术治疗以外，并没有药物干预治疗。
对于比较小的肾囊肿，在日常的生活中，并不需要限制患者的活动以及饮食，但是需要定期进行B超的检测，观察肾囊肿的大小以及数目。