阴道内部的尖锐湿疣，可以通过外观形态和实验室检查进行辨别。
阴道内部的尖锐湿疣，因阴道环境长期处于潮湿的状态，所以与外阴部位的尖锐湿疣的形态不太一样。典型阴道内部的尖锐湿疣，可以呈现密集排列的绒毛样外观。但是，用手触摸质地要比正常的阴道皱襞略硬，而且稍微用力，即可在这种绒毛状外观表面见到渗血状态。
如果阴道内部有尖锐湿疣，做妇科内诊或性生活的时候，比较容易流血。一旦发现类似的皮损，需要采集脱落细胞做人类乳头瘤病毒检查，发现6型、11型、16型、18型病毒，则可以确诊为阴道内尖锐湿疣。