心肌肥大的主要危害包括两个方面：
一、心肌肥大可以导致心肌的顺应性明显下降，容易发生舒张功能不全。
二、心肌肥大导致心肌的需氧量增加，而肥大的心肌细胞不能从血液里面获得足够的氧气和养料，容易使心肌发生相对性的缺血缺氧，逐渐引起心肌损害，导致心肌凋亡、心肌纤维化，最终引起心脏逐渐扩大，导致心力衰竭，还会在心肌纤维化的基础上出现电重构，导致心律失常的发生。
对于心肌肥大的患者，要积极的去除导致心肌肥大的病因，如高血压的患者积极的控制血压，还要给予抑制心肌重构的药物如ACEI或ARB等，以抑制心肌肥大。