小儿两性畸形是由于小儿在胚胎时期性器官的发育出现畸形引起来的。小儿在出生以后会有睾丸，还有阴道，有的小儿还会出现性器官的缺失，比如可能会没有睾丸或者是没有阴道，以及会出现尿道畸形。
有的男孩还会出现有乳房发育、体毛减少等一系列的症状，需要检查小儿的外生殖器，再做B超检查，看一下小儿的内生殖器，还有染色体等等一些检查，看看小儿是适合做女性还是男性。
在治疗上主要是以手术治疗为主，对小儿的性器官进行整形手术，然后再使用一些激素类的药物配合治疗，做好小儿的心理护理，引导小儿认同自己的性别。