嗜血细胞综合征的症状包括发热、贫血、出血、感染、脾大以及中枢神经系统症状等。
发生嗜血细胞综合征的时候，多数的患者有可能会出现发热，而且发热持续时间比较长，体温比较高，使用一般的抗感染药物效果不好。病人还有可能会出现脾大的表现，可以有腹胀、腹痛、食欲不振、消化不良、恶心、呕吐等，部分患者有可能会出现凝血功能障碍。
临床上出血的表现往往比较多，中枢神经系统的症状也比较多见，病人有可能会出现情绪障碍，通常还有可能会有皮肤的斑丘疹、皮肤的紫癜。如果是发生肺部损伤，有可能会出现呼吸困难等。