在临床上，血栓性外痔患者主张以手术治疗为主。如果血栓比较大，用药保守治疗不一定能将血栓消退，反而会引起肛门疼痛剧烈。如果血栓比较小，可以先保守用药治疗。
常用的内治法以清热凉血为主。常用中药凉血地黄汤加味，常用的药物有生地丹皮、槐角、黄芩、生地榆等。也可以用清热解毒片口服，配合外治法，如用苦参汤和五倍子汤熏洗或者用高锰酸钾热水坐浴，每次15到20分钟，每天1到2次，薰洗完后外敷消痔膏或者金黄膏，每天1到2次。如果用药治疗一个礼拜之后血栓仍不消退建议手术治疗。