引起输尿管结石的主要原因包括尿中晶体浓度过高和尿液理化性质改变两大方面。
具体如下一尿液晶体浓度过过高，正常尿液中含有多种晶体成分，如草酸盐、磷酸盐、碳酸盐、尿酸盐等，有些情况是体内晶体排出增多，可使尿内的晶体浓度增高。
二尿液理化性质的改变，尿液内晶体浓度正常，但尿液理化性质改变时可以促进结石形成，如尿液ph值改变可以影响晶体的溶解度。碱化尿液有利于磷酸钙草酸钙结石形成，酸性尿液容易形成尿酸结石和胱氨酸结石。
三其他因素尿路疾病，尿液PH值得改变及甲亢钙、磷代谢异常等可以引起输尿管结石。此外，饮食中动物蛋白维生素d摄入过多，维生素b6收入过少也可以诱发输尿管结石。