吃完避孕药肚子疼有可能是药物的不良反应，可能是避孕药对胃黏膜产生刺激，尤其患者有慢性胃炎或者消化性溃疡疾病时，口服避孕药后可能上述的不良反应更为严重。
因此在选择用药上需要到医院就诊，并且在医生的指导下使用，必要时可能需要调整用药或者是改变口服药物用药的方式，也可以调整口服用药的时间。
假如通过上述改变未能明显缓解时，则需要给患者口服保护胃肠黏膜的药物以及抑制胃酸分泌的药物，促进疾病的缓解，具体药物的用法根据医嘱执行。