红斑狼疮血、尿常规的异常代表血液系统和肾受损；血沉增快，表示疾病控制尚不满意。患者血清中可以查到多种自身抗体，它们的临床意义是红斑狼疮诊断的标记，疾病活动性的指标及可能出现的临床亚型，常见而且有用的自身抗体依次为抗核抗体谱，抗磷脂抗体和抗组织细胞抗体。
抗核抗体谱出现在红斑狼疮的有抗核抗体，抗双链DNA抗体，抗ENA抗体。抗核抗体见于几乎所有的红斑狼疮患者，由于它特异性低，阳性不能作为红斑狼疮与其他结缔组织病的鉴别。抗双链DNA抗体是诊断红斑狼疮的标记抗体之一，多出现在红斑狼疮的活动期，抗双链DNA抗体的含量与疾病活动性密切相关。抗磷脂抗体包括抗心磷脂抗体、狼疮抗凝物、梅毒血清试验假阳性等对自身不同磷脂成分的自身抗体，结合其特异的临床表现，可诊断是否合并有继发性结缔组织病。
补体低下，尤其是C3低下，常规提示红斑狼疮活动，C4低下表示红斑狼疮活动外，还可能是红斑狼疮易感性的表现。肾活检病理对狼疮肾的诊断治疗和预后估计都有价值，尤其对指导狼疮肾炎治疗有重要意义。X线检查及影像学检查有助于早期发现器官损害，如头颅MRI、CT对患者脑部的梗死性或出血性病灶的发现和治疗提供帮助，高分辨CT有助于早期肺间质性病变的发现，超声心动图对心包积液、心肌、心瓣膜病变、肺动脉高压等有较高敏感性而有利于早期诊断。