小儿包茎最好的治疗方法是包茎手术，要根据小儿的年龄以及包茎的严重程度，确定是否进行手术。
如果小儿的年龄小于5岁，没有出现感染或者排尿困难，包皮垢也不影响到正常的生活，先不要进行手术。可使用保守疗法使包皮口扩大，将阴茎头露出，清除包皮垢后，涂抹抗生素类的软膏，然后将包皮复位。多次进行治疗后，小儿包茎可治愈。
如果小儿出现了包皮龟头炎，或者其他排尿不适症状，影响到了阴茎正常的发育，使用保守疗法没有效果，可选用包皮环切术进行治疗。