发生组织细胞增殖症的时候，如果是骨嗜酸性的肉芽肿，往往会出现疼痛，伴随着颅骨、肋骨病变。局部有肿块、压痛，也可以有病理性的骨折及畸形。患者还可以有发热、食欲不振、体重减轻的症状，偶尔有可能会引起瘫痪。
黄色瘤病一般具有三大典型的特征：颅骨缺损、眼球突出以及尿崩症。这三大特征可以只具其一，很少会同时出现。或者还有可能会出现发育障碍、肝脾肿大、皮疹、色斑和牙龈溃疡等等；有的时候可以出现牙齿的松动、脱落。
如果是发生婴儿网织细胞增殖症的时候，临床上主要是出现发热。可以有复发性的细菌感染，还可以出现贫血、出血、肝脾肿大、淋巴结肿大等。