大多数的腰疼不是肾炎。因为腰疼不是肾炎特定的临床症状，只有少数肾炎的患者，在病情发展的过程中会伴随腰疼的症状。
一般腰疼见于很多疾病，常见的肾脏疾病有腰肌劳损、脊椎疾病等。急性胰腺炎也会出现腰部疼痛不适，妇科的盆腔疾病也会引起腰疼。引起腰疼的肾脏疾病有感染性疾病，比如肾盂肾炎、肾周围炎。也有囊肿性疾病，比如肾囊肿、多囊肾。还有肿瘤性疾病，比如肾癌。
除此以外，肾结石、输尿管结石、肾血管性疾病也是引起腰疼的原因，这些疾病都不是属于肾炎的范畴。