咽炎的发病和扁桃体手术后没有直接的关系，扁桃体手术只是直接切除了扁桃体，恢复完全后，不会导致咽炎的发病，咽炎的发病因素主要有：生活区域的寒冷和干燥气候，灰尘和化学气体对工作环境空气的污染，烟草、酒精和辛辣饮食的长期刺激，以及容易得咽喉炎。
咽喉炎反复发生，并可能成为慢性疾病。 邻近器官疾病，如扁桃体炎、牙龈炎、龋齿、慢性鼻炎、慢性鼻窦炎和其他炎性分泌物流入咽喉，或慢性鼻疾病，通过口呼吸造成鼻腔通气困难，以及由于长期刺激咽喉而引起慢性炎症变化。