腰椎穿刺是临床上用于诊断疾病的一种重要的辅助检查手段，尤其是在神经科的诊断和鉴别诊断当中起着非常重要的作用：
1.中枢神经系统炎症性疾病，化脓性脑膜炎、病毒性脑膜炎、乙型脑炎、结核性脑膜炎、霉菌性脑膜炎等。
2.脑血管意外的疾病，脑梗死、脑溢血、蛛网膜下腔出血等，对于以上两种疾病，腰椎穿刺可以明确诊断出来疾病。
3.对于肿瘤性疾病，比如脑膜白血病可以通过腰椎穿刺得到确诊，并在穿刺的时候可以直接腔内注射化疗药物来进行治疗。
腰椎穿刺还可以测定颅内的压力、了解蛛网膜下腔是否阻塞等，可以椎管内给药，所以如果病情需要最好做。