男性性功能检查项目较多，包括外生殖器体检、泌尿系彩超、血常规、尿常规、肝肾功能、血脂、血糖、性激素等实验室检查。
外生殖器体检主要检查勃起功能、男性的生殖器大小、形态、是否有肿块、有无压痛等，以及男性的射精情况。
泌尿系彩超可以查看睾丸和前列腺的情况，实验室检查主要包括前列腺液的化验，了解是否有慢性前列腺炎，因为慢性前列腺炎是造成男性性功能障碍的重要原因，此外男性性功能检查还包括心理因素方面的检查。