在女性生殖器官的形成和发育过程中，因受到遗传或外界环境的影响，原始的性腺内外生殖器的分化发育可能会发生改变，导致各种发育异常。 子宫纵隔，是由于两侧的副中肾管融合不全，在宫腔内形成纵膈，较为常见，从子宫底至宫颈内口，将宫腔完全隔为两部分，为完全纵隔。仅隔开部分为不全纵隔，纵膈子宫容易发生不孕流产，早产和胎位异常。如果胎盘附着在膈上，可出现产后胎盘滞留。
纵膈子宫外形正常，经超声、子宫输卵管造影或宫腔镜检查可以确诊。对有不孕和反复流产的纵隔子宫患者，可在腹腔镜监视下，通过宫腔镜切除纵隔，术后宫腔内置金属节育环，防止纵膈创面形成粘连，输液后取出节育环。