手足口病严重的患者极有可能会引起脑膜炎、脑炎、弛缓性麻痹、肺水肿等严重并发症，部分的患者可伴有咳嗽、流涕、食欲不振、呕吐、头疼等症状，多数患者在坚持治疗后能治愈，并且没有后遗症，最严重的后果是肺出血，往往危及患儿的生命。
家长如果发现儿童感染手足口病应该立刻去医院就医，谨遵医嘱。一些重症的手足口病，往往没有典型的表现，家长要注意如果患儿有明确的手足口病接触史，短期出现发热精神不佳要高度怀疑手足口病重症的可能，一定要及时就医。可以检查EV71及柯萨奇病毒，及时的确诊及时治疗，减少一些急危重症的出现。