包皮翻起后有水泡的原因有包皮龟头炎、过敏反应、疱疹病毒等。
1.包皮龟头炎。由于个人卫生不到位或者细菌、病毒等致病菌感染，导致患者龟头、包皮等发生炎症感染，炎症因子的不断刺激会造成龟头、包皮处的皮肤出现水肿、红肿、疼痛、水泡等症状。有时因为水泡的位置在包皮内侧，只有翻起来时才能看见。
2.过敏反应。如果患者对于某些物质过敏，例如花粉、沐浴露、动物毛发等，当接触这些过敏物质后会引发一系列的过敏反应，例如皮肤瘙痒、起红疹等。严重者可能会造成皮肤起水泡，从而导致包皮翻起来时有水泡的出现。
3.疱疹病毒。如果患者被疱疹病毒感染，造成龟头包皮出现水肿、起水泡等，因此当患者翻起包皮时就会看见水泡的存在。