同时感染新冠和流感是可以出现反复发烧的情况。对于新冠和流感同时患病的患者其病情会更加严重，此两种病毒感染机体后均可以引起发烧的症状。在新冠病毒和流感病毒同时感染机体后，患者全身炎症反应综合征更加严重，全身症状明显，患者因此可以出现反复发烧的症状。
另外，此类两种病毒混合感染的患者其机体的免疫力下降得更加明显，患者容易继发细菌或其他的致病原混合感染，可以并发细菌性肺炎或脓毒血症，此时患者因此也可以出现反复发烧或高烧不退的现象。
故对于新冠和流感同时感染的患者，要加强抗感染的同时，加强对症支持处理，防治相应的并发症以控制病情。