肾积水早期患者一般无症状，到后来出现腹部包块或者腰部胀感等症状的时候才到医院就诊，这个时候疼痛一般比较轻，甚至完全没有疼痛感。
但是，如果合并输尿管结石、输尿管狭窄等疾病时疼痛就会加重，并且可能会伴有发热、恶心、呕吐、腹胀、尿少等。肾积水在并发感染时，还会出现寒战、发热、神志障碍以及胃肠功能紊乱等症状，此时查尿常规可以显示尿白细胞增加。
但是，如果合并输尿管结石、输尿管肿瘤等疾病导致输尿管闭锁时，炎性渗出物不能够经尿排出，此时尿内可以没有白细胞。如果严重的肾积水，可能引起破裂和出血，这个时候会出现包括腰腹部疼痛、压痛以及全身症状。