舌下腺囊肿的手术在术后会有一定程度的痛苦，这种痛苦主要是局部的肿胀、疼痛，尤其是在吞咽或进食这种动作发生的时候会有疼痛。
因为舌下腺囊肿的手术都是在口底舌下区进行的，这一部位做切口、手术操作，对肌肉和局部的组织会有一定的损伤，术后进行缝合。如果术后进行吞咽、说话这些动作，舌体会有运动，舌体运动的时候会对伤口和手术区产生一定的运动牵拉，必然会造成一定程度的疼痛。但是舌下腺囊肿手术的痛苦并不是很严重，经过一定的药物治疗和休息，2~3天后可以恢复，痛苦和难受程度会很快减轻。
所以对舌下腺囊肿手术，不要过分担心，应该积极接受手术治疗。但是术前从思想上要重视，要有充分思想准备。术后可能有一段时间在吞咽，包括咽口水、进食、说话的时候，都会有局部肿痛症状，是有一定痛苦的。